Tokyo, 2099. La faille temporelle a perturbé la Toile de la vie et du destin, laissant les héros du monde Marvel s'affronter pour réparer les dégâts causés par celle-ci. Une équipe menée par Peni Parker cherche à brancher la Toile dans le Cyberspace pour la réparer.

L'autre groupe, mené par Spider-Man, privilégie quant à lui une approche plus prudente en se servant du Chronovium pour renforcer la Toile et la laisser se réparer d'elle-même. Alors que la faille temporelle fait s'affronter les héros entre eux, quelle équipe va prendre le dessus sur les autres ?